تعبیر و تفسیر قرآن
سید مرتضی رسالات و کتابهایی در مسئله مربوط به علم ها قرآن دارااست؛ مانند کتابی که درباره معجزه قرآن با تیتر «الموضح عن وجه معجزه القرآن» نگاشته میباشد. علاوه بر آن، مباحث زیادی در تعبیروتفسیر قرآن مهربان از سید مرتضی به طور متفرق در اثرها متعدد وی به مکان باقی حسینیه نصرت مشهد مانده میباشد.
افزون بر رسالات کوتاه سید مرتضی در تعبیر بعضی نشانهها قرآن، نصیب عمدهای از تفسیرهای وی در کتاب الامالی گردآوریآوری گردیده است که در آن حدود ۱۴۰ آیه قرآن را گستردن و تعبیروتفسیر نموده است. وی همینطور در کتاب تنزیه الانبیاء به تعبیر نشانهها قرآن در امر انبیای الهی پرداخته میباشد.[۴۹] در بقیه اثر ها سید مرتضی مثلا اثر ها کلامی وی مانند الشافی نیز برخی نشانهها آیتم تحقیق قرار آدرس حسینیه نصرت مشهد گرفته میباشد.[۵۰]
سید مرتضی همچون شیوه عقلیاش در مباحث کلامی و دینی، در تعبیروتفسیر قرآن نیز روشی عقلگرایانه داراست و مبتنی بر اصول عقلی به تاویل آیاتی میپردازد که در ظواهر با اصول عقلی تعارض دارا هستند.[۵۱] او همینطور در تعبیروتفسیر قرآن رویکردی کلامی داراست و بیشتر به تعبیروتفسیر نشانهها اعتقادی پرداخته و تعبیر و تفسیر آیهها در اثر ها او با غرض تقویت فکرهای کلامی شیعه شکل می گیرد.[۵۲] خصوصیت دیگر تعبیروتفسیر سید مرتضی، راه ادبی وی و بازگشت به پوستههای لهجه و ذکر عربی و نیز مباحث کبیر لغتشناسانه برای ادراک معانی قرآنی رزرو حسینیه نصرت مشهد میباشد.[۵۳]
اثرها ادبی
تمبر یادبود «بزرگداشت هزاره سید مرتضی دانشالهدی»
سید مرتضی ادیبی ممتاز و سرشناس بود.[۵۴] از سید مرتضی اثر ها ادبی زیادی به مکان باقی مانده میباشد. به عنوان مثال شعرهای وی در شش جلد و همینطور کتاب مشهوری با تیتر «الدرر و الغرر» (اسم دیگر امالی سید مرتضی) دربرگیرنده مباحث ادبی و کلمهشناختی و نحوی.[۵۵] یافعی (از عالمان اهل سنت، درگذشتهٔ ۷۶۸ق) بعد از توصیفی کوتاه درباره این تاثیر، میگوید این کتابی میباشد که نشانه از فرهیختگی زیاد سید و گستردگی استحضار او از علمهای مختلف داراست.[۵۶] علاوه بر آن، سید مرتضی رسالههایی در عیب گیری اثر ها ادبی قبل از خویش شماره تلفن حسینیه نصرت مشهد نوشته میباشد.[۵۷]
بزرگداشت
نوشتهیعلمیٔ اساسی: کنگره در بینالمللی سید مرتضی دانشالهدی
در سال ۱۳۹۹ش یکسری گردهمایی مقدماتی کنگره هزاره سید مرتضی دانشالهدی با همیاری بنیاد رسیدگیهای اسلامی آستان قدس رضوی و مؤسسه دارالحدیث برگزار شد.[۵۸]
کنگره دربینالمللی و دین رونمایی اثرها سید مرتضی دانشالهدی پنجشنبه ۷ اسفند هم زمان با به دنیاآمدن امام علی(ع) در دارالحدیث قم برگزار شد.[۵۹]
تکنگاری
سید احمد حسینی اشکوری، تراجمنگار و ورژنشناس، کتابی با اسم حیاةُ الشَّریفِ الْمُرتضی با مورد معاشطومار سید مرتضی نگاشته نموده است.[۶۰]

مراسم محرم در حسینیه نصرت مشهد؛ راهنمای کامل حضور در مجالس عزاداری